رشد و ترقی دانشگاه در دهه اول تاسیس در سال 1959 منجر به مستقل شدن دو دانشگاه یکی در سنگاپور و دیگری در کوالالامپور گردید.
در سال 1960 دولت هر دو کشور تمایلشان را برای تغییر شرایط و تبدیل یک دانشگاه ملی اعلام کردند و قوانینی در سال 1961 وضع شد و دانشگاه مالایا در اول ژانویه 1962 تاسیس شد.
 "دانش کلید موفقیت" شعار دانشگاه است که انعکاس دهنده فلسفه دانشگاه در سعی و تلاش در کسب علم و دانش در همه زمینه هاست و سازنده جامعه ای موفق و تحصیل کرده و با دانش در علو م وتکنولوژی مدرن است.
دانشگاه مالایا قدیمی ترین مرکز آموزشی است که در مالزی تاسیس شده است که جشن صد ساله خود را در سال 2005 برگزار کرد.
می توان گفت در طول ده ها سال دانشگاه UM به عنوان تنها دانشگاه ملی مالزی مشغول به کار بوده است و از علت های موفقیت های این دانشگاه می توان به  داشتن نظم و قوانینی مشخص اشاره کرد که از رشته های هنری گرفته تا علمی گسترده شده است و بسیاری از اساتید و دانشمندان  برجسته کشور مالزی در این دانشگاه تحصیل کرده اند.این دانشگاه بقدری جایگاه ویژه ای دارد که از سایر کشورهای دیگر مخصوصا کشورهای نزدیک به مالزی دانشجویان تمایل به درس خواندن در آن را دارند.